MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. 8004 chromosome

Total Repeats: 18079

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007086	GC	3	6	7	12	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007086	CAGC	2	8	15	22	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007086	GAT	2	6	27	32	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007086	A	6	6	1400	1405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007086	CAC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007086	T	6	6	2793	2798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007086	TGCC	2	8	2843	2850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007086	TGC	2	6	2917	2922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007086	CGCA	2	8	2959	2966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007086	TGA	2	6	2975	2980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007086	TGG	2	6	3005	3010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007086	TGGC	2	8	3030	3037	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007086	CT	3	6	3086	3091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007086	CGG	2	6	3136	3141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007086	CT	3	6	3155	3160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007086	CAT	2	6	3214	3219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007086	TCT	2	6	3256	3261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007086	GTG	2	6	3362	3367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007086	GCC	2	6	3490	3495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_007086	CGC	2	6	3535	3540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_007086	GCA	2	6	3559	3564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007086	CCG	2	6	4741	4746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_007086	CG	3	6	4798	4803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007086	CCG	2	6	4813	4818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007086	CGTG	2	8	4823	4830	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007086	CCG	2	6	7299	7304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_007086	CCG	2	6	7311	7316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_007086	CG	3	6	7325	7330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007086	GCC	2	6	7345	7350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_007086	GAC	2	6	8222	8227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007086	TGC	2	6	9080	9085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007086	CGG	2	6	9186	9191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007086	ATC	2	6	10515	10520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007086	CGGC	2	8	11246	11253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007086	TCA	2	6	11285	11290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007086	CA	4	8	11292	11299	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007086	GTA	2	6	12081	12086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007086	CAACA	2	10	12975	12984	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_007086	T	7	7	13023	13029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007086	GCG	2	6	13032	13037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007086	TGC	2	6	13050	13055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007086	TGC	2	6	13070	13075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007086	CGT	3	9	13102	13110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007086	GCGAT	2	10	13133	13142	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007086	TGA	2	6	13159	13164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007086	GTT	2	6	13168	13173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007086	GCAA	2	8	13303	13310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007086	ATCGC	2	10	13335	13344	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_007086	AGT	2	6	13390	13395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007086	CAAAC	2	10	13444	13453	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_007086	GT	3	6	13475	13480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007086	TGA	2	6	13503	13508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007086	CGA	2	6	13540	13545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007086	CA	3	6	13551	13556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007086	GTC	2	6	13607	13612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007086	CACT	2	8	13682	13689	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007086	GCCG	2	8	13693	13700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007086	AGC	2	6	13713	13718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007086	AGT	2	6	13738	13743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007086	GAC	2	6	13753	13758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007086	CATC	2	8	13812	13819	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007086	AC	3	6	13825	13830	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007086	TCCAC	2	10	13832	13841	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_007086	CTT	2	6	13870	13875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007086	GCC	2	6	13935	13940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_007086	GACG	2	8	14057	14064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007086	GC	3	6	14088	14093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007086	TGC	2	6	14885	14890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007086	GGC	2	6	15180	15185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007086	GCG	2	6	15223	15228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007086	TGC	2	6	16722	16727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007086	GCT	2	6	16739	16744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007086	CGT	2	6	16840	16845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007086	GCAG	2	8	16889	16896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007086	CAG	2	6	16946	16951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007086	GCC	2	6	16962	16967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_007086	CTG	2	6	18140	18145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007086	CGT	2	6	18889	18894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007086	TGC	2	6	18900	18905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007086	CACG	2	8	18934	18941	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007086	GAT	2	6	18960	18965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007086	GTG	2	6	19014	19019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007086	CGG	2	6	19030	19035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007086	CGA	2	6	19065	19070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007086	GC	3	6	19141	19146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007086	CGG	2	6	19152	19157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007086	CGTG	2	8	19238	19245	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007086	GC	3	6	19251	19256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007086	GCC	2	6	19290	19295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_007086	CCATG	2	10	19435	19444	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_007086	CAA	2	6	19459	19464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007086	A	6	6	19463	19468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007086	CCG	2	6	19471	19476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_007086	GCA	2	6	19500	19505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007086	GCG	2	6	19506	19511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007086	GTT	2	6	20856	20861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007086	GCGCCC	2	12	20896	20907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_007086	GC	3	6	20929	20934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007086	C	9	9	20941	20949	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_007086	ACG	2	6	20955	20960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007086	ACG	2	6	20978	20983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007086	GGGT	2	8	21032	21039	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007086	GCCCT	2	10	21767	21776	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_007086	CGC	2	6	21788	21793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_007086	GTTGC	2	10	23117	23126	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_007086	TGC	3	9	23131	23139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007086	TCA	2	6	23176	23181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007086	GCA	2	6	23216	23221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007086	CGT	2	6	23257	23262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007086	CCG	2	6	23369	23374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_007086	CGGC	2	8	23411	23418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007086	TGC	3	9	23436	23444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007086	ATCG	2	8	23452	23459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007086	CG	3	6	23474	23479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007086	GTGC	2	8	23487	23494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_007086	GGT	2	6	23515	23520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007086	AGC	2	6	23541	23546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007086	TGA	2	6	23582	23587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007086	GCT	2	6	23670	23675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007086	CG	3	6	23741	23746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007086	AGTG	2	8	23755	23762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007086	ACC	2	6	23779	23784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_007086	AAG	2	6	23826	23831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007086	CGA	2	6	23856	23861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007086	CACCAG	2	12	23982	23993	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007086	GCA	2	6	24022	24027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007086	CTG	2	6	25660	25665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007086	TGC	2	6	25669	25674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007086	GCA	2	6	25740	25745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007086	GCG	2	6	25764	25769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007086	GCCA	2	8	27005	27012	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007086	GCGG	2	8	27020	27027	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007086	CGGGT	2	10	27032	27041	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007086	GCG	2	6	27053	27058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007086	AGG	2	6	27061	27066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007086	CAGG	2	8	27089	27096	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007086	CCG	2	6	27146	27151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_007086	CGG	2	6	27152	27157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007086	CAC	2	6	27831	27836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_007086	CGC	2	6	27863	27868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_007086	GAG	2	6	27872	27877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007086	CG	3	6	29689	29694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007086	GTG	2	6	29699	29704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007086	A	6	6	29786	29791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007086	GTC	2	6	29858	29863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007086	GGA	2	6	29883	29888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007086	CGCC	2	8	29932	29939	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_007086	GGC	2	6	29941	29946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_007086	GCT	2	6	29965	29970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_007086	CG	3	6	29991	29996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007086	GC	3	6	30003	30008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_007086	GTG	2	6	30529	30534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007086	A	7	7	30535	30541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_007086	TGC	2	6	30599	30604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_007086	AGCA	2	8	30698	30705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_007086	CGG	2	6	30722	30727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_007086	TCG	2	6	30770	30775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_007086	CAG	2	6	30781	30786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_007086	CGA	2	6	31956	31961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_007086	CGTT	2	8	32000	32007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_007086	CG	3	6	32054	32059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_007086	GAT	2	6	32069	32074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_007086	CAAA	2	8	32090	32097	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_007086	GCG	2	6	32121	32126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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168	NC_007086	TGCG	2	8	32300	32307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
169	NC_007086	GCT	2	6	32311	32316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_007086	GGC	2	6	33559	33564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_007086	GC	3	6	33641	33646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
173	NC_007086	A	6	6	33676	33681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_007086	TGCA	2	8	33716	33723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
175	NC_007086	CGC	2	6	33822	33827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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177	NC_007086	CG	3	6	33864	33869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
178	NC_007086	GCG	2	6	33871	33876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_007086	AGACGC	2	12	33913	33924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_007086	GCCT	2	8	33993	34000	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
182	NC_007086	CCT	2	6	35105	35110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_007086	GGC	2	6	35126	35131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_007086	GC	3	6	35208	35213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
185	NC_007086	TGA	2	6	35237	35242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_007086	TGT	2	6	36474	36479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
189	NC_007086	GGT	2	6	36532	36537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_007086	CGC	2	6	36571	36576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
192	NC_007086	TAGC	2	8	36628	36635	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
193	NC_007086	CGA	2	6	36671	36676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
194	NC_007086	TCA	2	6	36852	36857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_007086	GAC	2	6	36890	36895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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269	NC_007086	TGCAG	2	10	49586	49595	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
270	NC_007086	ACC	3	9	49673	49681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_007086	ACC	2	6	49714	49719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_007086	GCA	2	6	49720	49725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_007086	CAA	2	6	50180	50185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_007086	GC	3	6	50205	50210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
284	NC_007086	CGG	2	6	50239	50244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_007086	GC	3	6	50270	50275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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287	NC_007086	CGC	2	6	50351	50356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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